Komisi 1 – Organisasi dan Kerjasama
| Koordinator | : | Prof. Dr. Ir. Desrina, M.Sc |
| Anggota | : | 1. Wiwiek Winarti, S.Pi 2. Utari Octavianty, S.M 3. Dr. Desy Sugiani., M.Si 4. Dr. Heppi Iromo, S.Pi., M.Si 5. Dr. Alfabetian Harjuno Condro Haditomo, S.Pi., M.Si |
Komisi 2 – Ilmu Pengetahuan, Teknologi dan Inovasi Akuakultur
| Koordinator | : | Dr. Pande Gede Sasmita Julyantoro, S.Si., M.Si |
| Anggota | : | 1. Dr. Wa Iba, S.Pi., M.App.Sc 2. Dr. Munti Sarida, S.Pi., M.Sc 3. Mila Ayu Ambarsari, S.Pi., M.Si 4. I Gusti Ngurah Permana 5. Dr. Mochammad Farkan, A.Pi., SE., M.Si |
Komisi 3 – Pengembangan Usaha
| Koordinator | : | Ir. Haris Muhtadi |
| Anggota | : | 1. Anwar Hasan, S.Pi., M.Si 2. Putu Wira Sila, S.Pi 3. Ir. Virnanda Aprila Hapsara, S.Pt., M.M., IPU., ASEAN Eng 4. Resti Setiawati, S.Pi 5. Dr. Aziz, S.Pi., M.Si |
Komisi 4 – Hukum dan Advokasi
| Koordinator | : | Desliana Zulhida, SH |
| Anggota | : | 1. Indra Pranajaya, SE 2. Ir. Firman Pahrunsip, MM 3. Ratu Balqist Priesty Higina Satriawan, SE., M.Kel 4. Dr. Nur Rahmawati Arma 5. Achmad Jerryi |
Komisi 5 – Kepemudaan
| Koordinator | : | Dr. Ilham, S.St.Pi., M.Sc |
| Anggota | : | 1. Dr. Bayu Priyambodo 2. Syahrir, S.Pi., M.Si 3. Dr. Ahmad Suhermanto 4. Bayu Sesarahardian, M.Sc 5. Bela Rahma Sayida, S. Tr.Pi |
Lembaga dibawah MAI
| Lembaga Sertifikasi Profesi Akuakuakultur Indonesia | : | Prof. Dr. Yushinta Fujaya, MS |
| Jurnal Aquacultura Indonesiana | : | Prof. Dr. Ir. Rita Rostika, MP |
| PT Multidaya Akuakultur Indonesia | : | Drs. Muhibuddin Koto |